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NGS測序技術服務 DRIP-seq |
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基因芯片技術服務 Small RNA修飾芯片 m6A單堿基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表觀轉錄組芯片 circRNA表觀轉錄組芯片 |
NGS測序技術服務 RNA m6A甲基化測序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA堿基修飾檢測 tRNA堿基修飾檢測 |
PCR技術服務 MeRIP-PCR技術服務 m6A絕對定量RT-PCR技術服務 m6A單堿基位點PCR（MazF酶切法）技術服務 |
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基因芯片技術服務 DNA甲基化芯片 DNA羥甲基化芯片 ChIP-chip |
NGS測序技術服務 DNA甲?；奏?5fc)修飾測序 DNA 5hmC 測序（化學法） DNA甲基化測序 DNA羥甲基化測序 染色質免疫共沉淀測序 |
PCR技術服務 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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蛋白相對定量 TMT標記定量技術 非標定量技術 |
蛋白修飾 TMT標記定量磷酸化 非標定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 RNA-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
Arraystar m6A單堿基分辨率芯片利用RNA酶MazF對m6A敏感的特性，可在單堿基分辨率水平定位m6A位點，并對其進行定量。該芯片具有其它現存技術難以企及的優勢，是研究m6A動態變化、生物學功能以及疾病相關性的強大工具。Arraystar m6A 單堿基分辨率芯片技術擁有以下多種傳統m6A-Seq分析技術所不具備的優點：
? 一種檢測m6A的正交實驗方法：與以m6A抗體免疫共沉淀為基礎的MeRIP或miCLIP等技術不同，芯片提供了一種不依賴于抗體的m6A系統性檢測方法。點擊了解詳情>>
? 單堿基分辨率水平定位m6A位點：MeRIP-Seq技術的分辨率在100~200 nt左右，不能精準定位m6A，而芯片利用MazF酶，可在單堿基分辨率水平，準確檢測m6ACA位點。點擊了解詳情>>
? 定量m6A修飾：芯片可對m6ACA位點進行定量，解決了檢測m6A動態變化這個長期未得到滿足的科研需求。點擊了解詳情>>? 樣本需求量少：與MeRIP-Seq需要> 120 ug RNA相比，芯片對總RNA的要求量可低至1 ug，適用于稀有樣本，珍貴病理樣本，尤其是組織部位、低產量的篩選細胞以及小的動物模型等樣本。點擊了解詳情>>
? 可靠的位點收集與系統性注釋：Arraystar建立了特殊的收集注釋流程，對Single-ACA、Poly-ACA和Cluster-ACA上的可定量m6A位點進行了可靠收集和系統性注釋。了解這些m6A位點的功能意義，請點擊此處。
Aksomics（原康成生物）是Arraystar中國區唯一代理商，獨家為您提供Arraystar公司m6A單堿基分辨率芯片全程一站式技術服務。您只需要提供保存完好的組織或細胞標本，Aksomics的芯片技術服務人員就可為您完成全部實驗操作，并提供完整的實驗報告。同時，根據您的研究需要，Aksomics還提供各種深入數據挖掘服務。
Arraystar m6A單堿基分辨率芯片產品列表
| 服務 | 芯片 | 規格 | 描述 |
| Human m6A 單堿基分辨率芯片服務 | Arraystar Human m6A單堿基分辨率芯片 | 8×15K | 11,237個單一m6A位點; 3,084個多聚m6A位點; 693個成簇m6A位點 |
| Mouse m6A單堿基分辨率芯片服務 | Arraystar Mouse m6A單堿基分辨率芯片 | 8×15K | 11,120個單一m6A位點; 3,199個多聚m6A位點; 279個成簇m6A位點 |
| Rat m6A單堿基分辨率芯片服務 | Arraystar Rat m6A單堿基分辨率芯片 | 8×15K | 11,499個單一m6A位點; 3,082個多聚m6A位點; 2614個成簇m6A位點 |
RNA酶MazF可識別單鏈RNA上的ACA序列，并在第一個A的5’端進行切割，而如果第一個A攜帶m6A修飾（即m6ACA），則不能發生切割[5, 10]（圖1）。對經過MazF酶處理，因具有m6ACA序列而未被切割的RNA片段，以及未經MazF酶處理的Input RNA，進行雙色標記，然后與Arraystar單堿基分辨率芯片雜交，從而得到單堿基分辨率水平的m6A定量值（圖2）。該技術不依賴于半定量的m6A抗體免疫共沉淀技術，因此定量更加準確。
圖 1. MazF 酶切割未甲基化的（ACA）序列而不切割甲基化的（m6ACA）序列。
Arraystar單堿基分辨率芯片實驗流程包括：
? 總RNA片段化處理與DNase消化；
? MazF酶處理，切割未甲基化的（ACA）序列而保留完成的甲基化（m6ACA）序列。等份的未經MazF酶處理的RNA作為Input；
? 加入外參RNA Spike-ins，用作雜交信號校正；
? 分別合成cRNA，Cy5（紅光）標記MazF酶處理的樣本，Cy3（綠光）標記未經MazF酶處理的樣本；
? 將兩種熒光標記的cRNA混合，并與Arraystar單堿基分辨率芯片雜交；
? 雙色信號通道芯片數據分析與注釋。
圖2. Arraystar單堿基分辨率芯片實驗流程。
| Arraystar m6A 單堿基分辨率芯片 | Human | Mouse | Rat |
| 芯片規格 | 8 x 15K | 8 x 15K | 8 x 15K |
| 探針總數 | 14,321 | 14,319 | 14,581 |
| 探針長度 | 60nt | 60nt | 60nt |
| 單一m6ACA 位點 | 11,237 | 11,120 | 11,499 |
| 多聚m6ACA 位點 | 3,084 | 3,199 | 3,082 |
| 成簇m6ACA 位點 | 693 | 279 | 2,614 |
| m6ACA位點來源 | miCLIP dataset (Linder et al., 2015; Ke et al., 2015; Xu et al., 2017; Chen et al., 2015); RMbase database (Schwartz et al., 2013) | miCLIP dataset (Linder et al., 2015; Ke et al., 2015; Xu et al., 2017; Chen et al., 2015); RMbase database (Schwartz et al., 2013) | Mouse M6ACA site homologs (Linder et al., 2015; Ke et al., 2015; Xu et al., 2017; Chen et al., 2015); RMbase database (Schwartz et al., 2013) |
m6A單堿基分辨率芯片結果提供豐而詳細的生物信息學分析與注釋，包括單堿基m6A化學計量、m6A定位、位點類型（Single-, Multiple-, clustered m6A位點）、轉錄本區域等等。它們是理解m6A動態變化、生物學功能、分子機制和疾病相關性的必要信息，是目前其它技術所無法提供的。
