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NGS測序技術服務 DRIP-seq |
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基因芯片技術服務 Small RNA修飾芯片 m6A單堿基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表觀轉錄組芯片 circRNA表觀轉錄組芯片 |
NGS測序技術服務 RNA m6A甲基化測序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA堿基修飾檢測 tRNA堿基修飾檢測 |
PCR技術服務 MeRIP-PCR技術服務 m6A絕對定量RT-PCR技術服務 m6A單堿基位點PCR（MazF酶切法）技術服務 |
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基因芯片技術服務 DNA甲基化芯片 DNA羥甲基化芯片 ChIP-chip |
NGS測序技術服務 DNA甲?；奏?5fc)修飾測序 DNA 5hmC 測序（化學法） DNA甲基化測序 DNA羥甲基化測序 染色質免疫共沉淀測序 |
PCR技術服務 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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蛋白相對定量 TMT標記定量技術 非標定量技術 |
蛋白修飾 TMT標記定量磷酸化 非標定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 RNA-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
對差異m6A基因/轉錄本進行qPCR驗證是表觀轉錄研究必不可少的步驟?？党缮锾峁┡cMeRIP-Seq相對應的MeRIP-PCR服務，保證最優的實驗流程與最佳的技術方案。
圖一. MeRIP-PCR實驗流程圖。
康成丨數譜生物服務特色：
●優化的實驗流程
●特異性強的m6A抗體
●通過嚴格測試的引物
MeRIP-PCR既可對完整的m6A轉錄本（Intact）進行檢測，也可對該轉錄本的m6A修飾區域（m6A-deposited Fragments）進行檢測。
(Zhang et al., 2017, Cancer Cell 31, 1–16)
Normalize each MeRIP RNA fractions’ Ct value to the Input RNA fraction Ct value for the same qPCR Assay (ΔCt) to account for chromatin sample preparation differences. Calculate the % Input for each MeRIP fraction:
%Input=2(Ct Input-Ct MeRIP)×Fd×100% Here, Fd is Input dilution factor.
For example, if one- thirtieth of input mRNA and one-fifth of MeRIP mRNA were used for qPCR assays, Fd =5/30 =1/6
Fold Enrichment=2[ POS(CT Input-Ct MeRIP)-NEG (CT Input-Ct MeRIP) ]
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sample |
Input-IP |
Input-neg |
IP/neg |
||||
|
input(Ct) |
IP(Ct) |
% |
input(Ct) |
neg(Ct) |
% |
||
|
2FVector C1 |
27.515 |
32.061 |
0.71 |
27.515 |
NA |
0.01 |
61.35 |
|
2F4E C3 |
27.287 |
32.885 |
0.34 |
27.287 |
NA |
0.01 |
34.65 |
|
2FVector C5 |
26.652 |
25.811 |
29.85 |
26.652 |
NA |
0.01 |
4669.09 |
|
2F4E C6 |
26.018 |
25.145 |
30.52 |
26.018 |
NA |
0.00 |
7408.39 |
|
2F4E C3/2FVector C1 |
|
0.48 |
|
0.85 |
|
||
|
2F4E C6/2FVector C5 |
|
1.02 |
|
0.64 |
|
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