單細胞測序技術服務 單細胞全轉錄組測序 |
NGS測序技術服務 DRIP-seq |
基因芯片技術服務 Small RNA修飾芯片 m6A單堿基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表觀轉錄組芯片 circRNA表觀轉錄組芯片 |
NGS測序技術服務 RNA m6A甲基化測序(MeRIP Seq) |
LC-MS mRNA堿基修飾檢測 tRNA堿基修飾檢測 |
PCR技術服務 MeRIP-PCR技術服務 m6A絕對定量RT-PCR技術服務 m6A單堿基位點PCR(MazF酶切法)技術服務 |
基因芯片技術服務 DNA甲基化芯片 DNA羥甲基化芯片 ChIP-chip |
NGS測序技術服務 DNA甲?;奏?5fc)修飾測序 DNA 5hmC 測序(化學法) DNA甲基化測序 DNA羥甲基化測序 染色質免疫共沉淀測序 |
PCR技術服務 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
蛋白相對定量 TMT標記定量技術 非標定量技術 |
蛋白修飾 TMT標記定量磷酸化 非標定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 RNA-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
lncRNA芯片結果包含基本數據分析有哪些?深入數據分析有哪些?
基本數據分析:差異表達mRNA及LncRNA;分層聚類,Scatter Plot(散點圖),volcano plot;差異表達mRNA的GO和pathway分析;特色lncRNA子類分析。
深入數據分析:CNC分析;ceRNA分析;趨勢(STEM)分析;lncRNA-GSEA分析;差異高保守lncRNA、差異組織特異性lncRNA、差異生物學過程相關lncRNA、差異疾病相關lncRNA分析(僅針對human lncRNA芯片 V4.0)。
為什么LncRNA芯片報告中有重復行?
LncRNA有重復行是因為報告中會注釋lncRNA的臨近基因轉錄本,而當一個lncRNA有多個臨近基因轉錄本,在報告中的具體表現就是出現多行,而每一行的區別就是注釋的Associated_gene_acc名稱不同。
我想在購買芯片服務之前看看感興趣的lncRNA是否在芯片上。貴公司是否可以提供芯片上所有lncRNA探針的詳細序列列表?
是否每個lncRNA都有polyA 尾巴?數據庫里是否是全長序列,是否一定要做RACE?
約75%的lncRNA具有polyA尾巴,其余的沒有?!皊ource”為RefSeq、UCSC或GENCODE數據庫的lncRNA是經過充分驗證確定的lncRNA,不用做RACE,更建議選用?!皊ource”為其他數據庫的lncRNA需要RACE獲取詳細的序列信息。
Arraystar lncRNA芯片探針設計如何做到轉錄本特異性?有什么優勢?
同一個基因轉錄的不同轉錄本都設計有單獨的檢測探針,這些探針設計在不同轉錄本特異的區域,如外顯子剪接拼接位點。能夠實現對不同轉錄本的準確、特異性檢測,這對分析lncRNA功能極為關鍵。