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單細胞測序技術服務 單細胞全轉錄組測序 |
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NGS測序技術服務 DRIP-seq |
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基因芯片技術服務 Small RNA修飾芯片 m6A單堿基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表觀轉錄組芯片 circRNA表觀轉錄組芯片 |
NGS測序技術服務 RNA m6A甲基化測序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA堿基修飾檢測 tRNA堿基修飾檢測 |
PCR技術服務 MeRIP-PCR技術服務 m6A絕對定量RT-PCR技術服務 m6A單堿基位點PCR（MazF酶切法）技術服務 |
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基因芯片技術服務 DNA甲基化芯片 DNA羥甲基化芯片 ChIP-chip |
NGS測序技術服務 DNA甲?；奏?5fc)修飾測序 DNA 5hmC 測序（化學法） DNA甲基化測序 DNA羥甲基化測序 染色質免疫共沉淀測序 |
PCR技術服務 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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蛋白相對定量 TMT標記定量技術 非標定量技術 |
蛋白修飾 TMT標記定量磷酸化 非標定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 RNA-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
rtStar? tRF&tiRNA預處理試劑盒用于qPCR的cDNA合成之前的tRF & tiRNA樣品制備。該試劑盒通過去除tRF和tiRNA片段中經常存在的3’環磷酸和5’羥基，產生了可以連接接頭的3’羥基和5’磷酸末端。tRF和tiRNA片段內部的 m1A、m1G 和 m3C修飾也被去甲基化以實現高效的 cDNA 逆轉錄。
rtStar? tRF&tiRNA第一鏈cDNA合成試劑盒將預處理的 tRF 和 tiRNA 片段轉化為用于 qPCR 反應的 cDNA。 該方法依次將 3'-Adaptor 連接到 RNA 的 3'-末端，將 5'-Adaptor 連接到 RNA 的 5'-末端。
產品優勢
?有效去除內部修飾以確保 cDNA 合成過程中逆轉錄酶的順利進行，解除修飾對常規cDNA合成的影響
?進行末端修復，以保證產生適合連接接頭的3’羥基和5’磷酸末端
?有效區分tRF&tiRNAs和其前體
?與未處理的樣本相比，預處理極大地增加了tRF&tiRNA檢測的靈敏度、定量精確性和檢出區分度
| 產品名稱 | 貨號 | 規格 | 產品描述 |
|---|---|---|---|
| rtStar? tRF&tiRNA Pretreatment Ki | AS-FS-005 | 12 Reactions | 3’氨?；┒巳コ?/span> 3‘環磷酸末端去除 5’羥基末端磷酸化 m1A、m1G、m3C去甲基化 |
| rtStar? tRF&tiRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit | AS-FS-003 | 6 Reactions | 依次將 3'-Adaptor 連接到 RNA 的 3'-末端，將 5'-Adaptor 連接到 RNA 的 5'-末端 |
| rtStar? tRF&tiRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit | AS-FS-003-02 | 12 Reactions | 依次將 3'-Adaptor 連接到 RNA 的 3'-末端，將 5'-Adaptor 連接到 RNA 的 5'-末端 |
tRFs&tRF&tiRNA是一類由tRNA發生精確切割而產生的非編碼小RNA分子，近來研究表明，這類小RNA分子具有多種生物學功能，比如類似于microRNA參與RNA干擾；調節靶向mRNA的穩定性；在細胞應激條件下促進應激顆粒(SG)的組裝；以及調控細胞凋亡等。此外，tRFs&tiRNAs還與癌癥、神經退行性疾病等多種疾病緊密關聯。 然而，tRF&tiRNAs 的分子特性對其精確的表達定量造成了挑戰。 由于其獨特的前體與切割方式，tRF&tiRNAs攜帶有多種內部或末端修飾。tRF和tiRNA可能保留了來源的tRNA上的甲基化修飾（m1A、m1G和m3C等）和氨?；┒?，tiRNAs常由RNA內切酶Angiogenin切割產生，這類內切酶會在切割位點產生5‘羥基（5’-OH）末端與3’環磷酸（3‘-cP）末端。許多當前標準的cDNA文庫構建方法，特別是針對小非編碼RNA的方法，包含了將3’和5’寡核苷酸接頭連接到RNA的3’和5’末端的接頭連接步驟，需要底物小RNA 5’端為磷酸，3‘端為羥基。此外，tRFs&tiRNAs的內部修飾比如m1A, m1G與m3C會嚴重阻礙反轉錄過程。為了準確檢測tRFs&tiRNAs，這些修飾必須被有效的去除。
圖1. tRF&tiRNA的常見修飾可以干擾接頭連接和cDNA合成，從而顯著降低cDNA文庫構建的質量
此外，tRF&tiRNAs 是通過精確的生物發生過程從 tRNA 或 pre-tRNA 產生的。 傳統的 qPCR 很難將 tRF&tiRNA 與其前體（tRNA 或 pre-tRNA）區分開來，因為它們共享相同的序列。 為了實現 tRFs&tiRNAs 的高保真和準確定量，Arraystar 開發了一個優化的檢測系統，由兩個產品組成：rtStar? tRF&tiRNA Pretreatment Kit 和 rtStar? tRF&tiRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit。 預處理試劑盒旨在去除 tRF和tiRNA的內部和末端修飾。 通過在 tRF&tiRNA 的 3' 和 5' 端引入兩個人工序列，第一鏈cDNA試劑盒可以有效地將 tRF&tiRNA 與其前體和其他小 RNA 區分開來。
