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單細胞測序技術服務 單細胞全轉錄組測序 |
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NGS測序技術服務 DRIP-seq |
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基因芯片技術服務 Small RNA修飾芯片 m6A單堿基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表觀轉錄組芯片 circRNA表觀轉錄組芯片 |
NGS測序技術服務 RNA m6A甲基化測序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA堿基修飾檢測 tRNA堿基修飾檢測 |
PCR技術服務 MeRIP-PCR技術服務 m6A絕對定量RT-PCR技術服務 m6A單堿基位點PCR（MazF酶切法）技術服務 |
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基因芯片技術服務 DNA甲基化芯片 DNA羥甲基化芯片 ChIP-chip |
NGS測序技術服務 DNA甲?；奏?5fc)修飾測序 DNA 5hmC 測序（化學法） DNA甲基化測序 DNA羥甲基化測序 染色質免疫共沉淀測序 |
PCR技術服務 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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蛋白相對定量 TMT標記定量技術 非標定量技術 |
蛋白修飾 TMT標記定量磷酸化 非標定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 RNA-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
產品列表
| 芯片名稱 | 貨號 | 規格 | 描述 |
|---|---|---|---|
| NuRNA? Human Central Metabolism PCR Array | AS-NM-004-1 | 384-well/plate | 檢測373個編碼重要代謝酶與代謝物轉運蛋白的轉錄本 |
| NuRNA? Human Central Metabolism PCR Array (Roche Light Cycler 480) | AS-NM-004-1-R | 384-well plate |
產品特點
?覆蓋度高—覆蓋了關鍵代謝途徑與重要代謝物轉運系統中的酶和蛋白因子
?注釋全面—整合了基因/轉錄本水平信息與蛋白水平信息，為每個代謝基因提供詳細注釋
?轉錄本水平檢測—檢測編碼Uniprot經典蛋白的轉錄本
?嚴謹性強—所有引物都通過了多樣本嚴格測試
?快速簡易—即用型384孔板規格，只需將cDNA與qPCR Master Mix混合試劑加入PCR板中，4小時內得到實驗結果。cDNA無需預先擴增。
為保證NuRNA? Central Metabolism PCR芯片的實驗效果，建議配套使用Arraystar rtStar? First-Strand cDNA Synthesis Kit (AS-FS-001) 和 Arraystar SYBR? Green Real-time qPCR Master Mix
新陳代謝是機體生命活動的基礎，影響細胞的各個方面。生長、增殖、分化或凋亡等不同的細胞過程，存在著顯著不同的代謝網絡[1,4]。細胞內的新陳代謝除了受信號通路等多種機制調控外，也可作為信號分子，或獨立調控生物學過程[8]。研究表明，新陳代謝參與調控表觀遺傳[6,7]、自噬[3,5]、凋亡、壞死[9]等多種細胞生命活動。代謝異常是引起肥胖、糖尿病及腫瘤等多種疾病的重要因素（圖1）。腫瘤被認為是一種代謝疾病，代謝改變是癌癥發生的顯著標志之一。癌細胞進行代謝重編程，以滿足腫瘤轉化、起始、發展、侵襲與遷移等不同階段以及不同營養環境下的代謝需求[1,8]（圖2）。系統地分析疾病的代謝改變，對尋找有效的代謝標記物與疾病治療靶點非常必需。
Arraystar公司推出的NuRNA?
Human Central Metabolism PCR Array，可同時檢測373個編碼重要代謝酶與代謝物轉運蛋白的轉錄本，是進行代謝研究必不可少的工具。該芯片檢測的代謝通路與代謝物轉運系統包括：葡萄糖轉運蛋白，糖酵解、TCA循環、脂類合成、乳酸合成及轉運、糖異生途徑、糖原代謝、氨基己糖代謝、磷酸戊糖旁路、一碳單位代謝、谷氨酰胺轉運及代謝、氧化還原平衡與GSH合成、脂肪酸氧化、乙酸代謝、核苷酸代謝等。研究不同生物學過程的代謝特征，尋找生理病理狀態下的代謝改變，將有助于深入理解細胞生命活動，并為代謝疾病的治療提供新的思路。
圖1.新陳代謝與生理病理過程。
圖2.腫瘤代謝示意圖
參考文獻
1. Agathocleous, M., and Harris, W.A. (2013). Metabolism in physiological
cell proliferation and differentiation. Trends in cell biology 23, 484-492,
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9. Vanden Berghe, T., et al. (2014). Regulated necrosis: the expanding
network of non-apoptotic cell death pathways. Nature reviews Molecular cell
biology 15, 135-147, PMID:24452471.
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葡萄糖轉運(13): SLC2A1, SLC2A2, SLC2A3, SLC2A4, SLC2A5, SLC2A6, SLC2A7, SLC2A8, SLC2A9, SLC2A10, SLC2A11, SLC2A12, SLC2A14 糖酵解(36): ADPGK, ALDOA, ALDOB, ALDOC, BPGM, ENO1, ENO2, ENO3, GAPDH, GAPDHS, GCK, GPI, HK1, HK2, HK3, HKDC1, PFKFB1, PFKFB2, PFKFB3-isoform 1, PFKFB3-isoform 2, PFKFB3-isoform 3, PFKFB3-isoform 4, PFKFB4, PFKL, PFKM, PFKP, PGAM1, PGAM2, PGAM4, PGK1, PGK2, PKL, PKM1, PKM2, PKR, TPI1 乳酸合成及轉運(18): LDHA, LDHB, LDHC, LDHAL6A, LDHAL6B, UEVLD, SLC16A1, SLC16A2, SLC16A3, SLC16A4, SLC16A5, SLC16A6, SLC16A7, SLC16A8, SLC16A9, SLC16A10, SLC16A11, SLC16A12 糖異生(13): BCAT1, BCAT2, FBP1, FBP2, G6PC, G6PC2, G6PC3, GPT, GPT2, LDHD, PC, PCK1, PCK2 糖原代謝(6): GBE1, GYS1, GYS2, PGM1, PGM2, UGP2 氨基己糖代謝(6): GFPT1, GFPT2, GNPNAT1, PGM3, UAP1, UAP1L1 PPP途徑(15): G6PD, H6PD, PGD, PGLS, PRPS1, PRPS1L1, PRPS2, RBKS, RPE, RPEL1, RPIA, TALDO1, TKT, TKTL1, TKTL2 脂類合成(31): ACACA, ACACB, ACAT1, ACAT2, ACLY, ACSBG1, ACSBG2, ACSL1, ACSL3, ACSL4, ACSL5, ACSL6, ACSM1, ACSM2A, ACSM2B, ACSM3, ACSM4, ACSM5, FADS1, FADS2, FASN, GPD1, GPD1L, HMGCR, HMGCS1, HMGCS2, MLYCD, SCD, SCD5, SLC25A1, SLC27A2 一碳單位代謝(28): AHCY, AHCYL1, AHCYL2, AMT, BHMT, DHFR, DHFRL1, DLD, DNMT1, DNMT3A, DNMT3B, DNMT3L, GCSH, GLDC, MAT1A, MAT2A, MAT2B, MTHFD1, MTHFD1L, MTHFD2, MTHFD2L, MTHFR, MTR, PHGDH, PSAT1, PSPH, SHMT1, SHMT2 TCA循環(42): ACO1, ACO2, D2HGDH, DHTKD1, DLAT, DLD, DLST, FH, IDH1, IDH2, IDH3A, IDH3B, IDH3G, L2HGDH, MDH1, MDH1B, MDH2, OGDH, OGDHL, PDHA1, PDHA2, PDHB, PDHX, PDK1, PDK2, PDK3, PDK4, PDP1, PDP2, PDPR, SDHA, SDHAF1, SDHAF2, SDHAF3, SDHAF4, SDHB, SDHC, SDHD, SUCLA2, SUCLG1, SUCLG2, UEVLD 谷氨酰胺轉運及降解(18): GLS2, GLS-isoform 1, GLS-isoform 2, GLS-isoform 3, GLUD1, GLUD2, GOT1, GOT2, SLC1A1, SLC1A2, SLC1A3, SLC1A4, SLC1A5, SLC1A6, SLC38A1, SLC38A3, SLC38A5, SLC38A7 氧化還原平衡(16): CBS, CTH, G6PD, GCLC, GCLM, GSR, GSS, IDH1, IDH2, ME1, ME2, ME3, MTHFD1, NNT, PGD, SLC7A11 GSH合成(7): CBS, CTH, GCLC, GCLM, GSR, GSS, SLC7A11 脂肪酸氧化(51): AADAC, ABHD12, ABHD6, ACAA1, ACAA2, ACAD10, ACAD11, ACAD8, ACAD9, ACADL, ACADM, ACADS, ACADSB, ACADVL, ALDH1B1, ALDH2, ALDH3A2, ALDH7A1, ALDH9A1, CEL, CPT1A, CPT1B, CPT1C, CPT2, ECH1, ECHS1, ECI1, ECI2, EHHADH, ETFA, ETFB, HADH, HADHA, HADHB, HSD17B10, HSD17B4, LIPC, LIPE, LIPF, LIPG, MGLL, PAFAH1B1, PAFAH1B2, PAFAH1B3, PNLIP, PNLIPRP1, PNLIPRP2, PNLIPRP3, PNPLA2, PNPLA3, SCP2 乙酸代謝(4): ACOT12, ACSS1, ACSS2, ACSS3 核苷酸代謝(83): ADA, ADCY1, ADCY10, ADCY2, ADCY3, ADCY4, ADCY5, ADCY6, ADCY7, ADCY9, ADSL, ADSS, ADSSL1, AK1, AK2, AK3, AK4, AK5, AK6, AK7, AK8, AK9, AMPD1, AMPD2, AMPD3, APRT, ATIC, CAD, CANT1, CDA, CECR1, CMPK1, CMPK2, CTPS1, DCK, DCTD, DHODH, DTYMK, DUT, GART, GDA, GMPS, GUCA1A, GUCA1B, GUCA1C, GUCA2A, GUCA2B, GUCD1, GUCY1A2, GUCY1A3, GUCY1B3, GUCY2C, GUCY2D, GUCY2F, GUK1, HPRT1, IMPDH1, IMPDH2, NME1, NME2, NME3, NME4, NME6, NME7, NT5C2, PAICS, PDE10A, PDE4D, PFAS, PNP, PPAT, RRM1, RRM2, RRM2B, TK1, TK2, TYMP, TYMS, UCKL1, UMPS, UPP1, UPP2, XDH |
適用的PCR儀
ABI ViiA? 7
ABI 7500 & ABI 7500 FAST
ABI 7900HT
ABI QuantStudio? 6 Flex Real-Time PCR system
ABI QuantStudio? 7 Flex Real-Time PCR system
ABI QuantStudio? 12K Flex Real-Time PCR System
Bio-Rad CFX384
Bio-Rad iCycler & iQ Real-Time PCR Systems
Eppendorf Realplex
QIAGEN Rotor Gene Q 100
Roche Light Cycler 480
Stratagene Mx3000
Roche Light Cycler 480
Aksomics使用Arraystar的芯片為客戶提供服務，以下為相關資料:
產品說明書：
Manual_NuRNA?__Human_Central_Metabolism_PCR_Array_v1.01
分析工具： 
Analysis Tool for NuRNA? Human Central Metabolism PCR Array v1.0
